VMware NSX導入時に、日々の運用でどういった事をしなければならないのかを検討する必要があります。そのひとつが各種コンポーネント(NSX Manager,NSX Controller,NSX Edge)のバックアップ、リストア手順がそれにあたると思います。
VMware NSX 6.xコンポーネントのバックアップとリストア設計については、以下のKBが参考になります。
>>VMware NSX for vSphere 6.x コンポーネントのバックアップとリストア (2145635)
上記KBでは、VMware NSX for vSphere 6.x コンポーネント(NSX Manager、コントローラ ノード、NSX Edge(DLR、ESG))のバックアップとリストアについて言及されています。
ちなみに、VMwareでは、NSX Managerを使用したNSX Edge およびコントローラのバックアップのみをサポートしますので、その他のバックアップ方式を利用する場合は、事前に動作確認するなど、問題なくリストアできるかどうかが問題になる可能性がありますので、特に弊害がなければ、推奨のバックアップ、リストアを使用するのが望ましいです。
・バックアップ ファイルは、NSX Manager がアクセスできるリモート FTP または SFTP の場所に保存されます。NSX Manager データには、構成テーブル、イベント テーブル、監査ログ テーブルが含まれます。構成テーブルは、すべてのバックアップに含まれます。
・リストアは、バックアップ バージョンと同じ NSX Manager バージョンでのみサポートされます。そのため、NSX アップグレードを実行する前と後に新規のバックアップ ファイルを作成し、古いバージョンと新しいバージョンのそれぞれにバックアップを作成することが重要です。
バックアップ先は、FTP、もしくはSFTPサーバーでよいかと思います。そして、NSX Controller、NSX Edgeの設定情報は、このNSX Managerのバックアップが保持している為、これらのバックアップは不要です。